Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms