Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms