Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P20040 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P20040 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P20040 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P20040 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P20040 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P20040 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P20040 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P20040 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P20040 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P20040 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P20040 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P20040 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P20040 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P20040 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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