Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrphP15331 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrphP15331 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrphP15331 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrphP15331 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrphP15331 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrphP15331 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrphP15331 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrphP15331 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms