Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnmt1P13864 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnmt1P13864 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms