Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms