Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp1P12032 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timp1P12032 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms