Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms