Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefmP08553 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefmP08553 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefmP08553 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefmP08553 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefmP08553 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefmP08553 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NefmP08553 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NefmP08553 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NefmP08553 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NefmP08553 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NefmP08553 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NefmP08553 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NefmP08553 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms