Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NeflP08551 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NeflP08551 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NeflP08551 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NeflP08551 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeflP08551 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms