Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr1P08046 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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