Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06344 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06344 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06344 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06344 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms