Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06336 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06336 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06336 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06336 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms