Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01635 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01635 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01635 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01635 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01635 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01635 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01635 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01635 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms