Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Robo1O89026 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Robo1O89026 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Robo1O89026 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Robo1O89026 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Robo1O89026 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Robo1O89026 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Robo1O89026 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms