Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apaf1O88879 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms