Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb2O88838 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb2O88838 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb2O88838 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms