Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tom1O88746 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tom1O88746 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms