Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BlmO88700 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BlmO88700 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BlmO88700 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BlmO88700 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BlmO88700 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BlmO88700 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BlmO88700 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BlmO88700 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BlmO88700 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
BlmO88700 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BlmO88700 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BlmO88700 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BlmO88700 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BlmO88700 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BlmO88700 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BlmO88700 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BlmO88700 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BlmO88700 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms