Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms