Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms