Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms