Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itgb5O70309 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms