Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lnx1O70263 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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