Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AurkbO70126 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkbO70126 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms