Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NlkO54949 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NlkO54949 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NlkO54949 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NlkO54949 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NlkO54949 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NlkO54949 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NlkO54949 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NlkO54949 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NlkO54949 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NlkO54949 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NlkO54949 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms