Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms