Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms