Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Limk2O54785 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limk2O54785 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms