Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn1O35350 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn1O35350 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn1O35350 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms