Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ColqO35348 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ColqO35348 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ColqO35348 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ColqO35348 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ColqO35348 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms