Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna3O35344 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms