Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CenpaO35216 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms