Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms