Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap23O09044 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap23O09044 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap23O09044 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms