Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms