Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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