Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm17577J3QNF7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm17577J3QNF7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms