Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms