Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms