Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20830J3KML6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20830J3KML6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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