Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AK157302I3ITR1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AK157302I3ITR1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AK157302I3ITR1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AK157302I3ITR1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AK157302I3ITR1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AK157302I3ITR1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AK157302I3ITR1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AK157302I3ITR1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms