Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc4lG5E8X2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms