Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r12G5E8G1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms