Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 692.7 ms