Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms