Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms