Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6F8VPZ5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms