Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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H2-M1F7CXU4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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