Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D430041D05RikF6ZGR6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
D430041D05RikF6ZGR6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms